More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3773 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3773  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 
399 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3994  malate dehydrogenase  87.26 
 
 
404 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4481  malate dehydrogenase  68.92 
 
 
397 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.437151  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3977  malate dehydrogenase  68.01 
 
 
391 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3991  malate dehydrogenase  68.01 
 
 
391 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4051  malate dehydrogenase  68.01 
 
 
391 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  0.971942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30630  malic enzyme  68.17 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235375  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0588  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65.98 
 
 
405 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6279  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  69.15 
 
 
392 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.69879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  59.84 
 
 
394 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.67 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  59.83 
 
 
464 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  60.39 
 
 
416 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  60.66 
 
 
399 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  60.39 
 
 
428 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  59.28 
 
 
395 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.84 
 
 
397 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  58.9 
 
 
396 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2214  malate dehydrogenase  68.18 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.38 
 
 
405 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  55.37 
 
 
481 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  60.06 
 
 
391 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.95 
 
 
489 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  60.38 
 
 
411 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4075  malate dehydrogenase  59.78 
 
 
391 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0926309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  60.17 
 
 
408 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  56.45 
 
 
470 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.03 
 
 
468 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  53.8 
 
 
473 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.38 
 
 
467 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.52 
 
 
407 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.96 
 
 
460 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  51.21 
 
 
414 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  51.21 
 
 
414 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  57.42 
 
 
473 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.07 
 
 
481 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.54 
 
 
484 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  54.11 
 
 
474 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  53.06 
 
 
474 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  54.17 
 
 
466 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.19 
 
 
478 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  53.99 
 
 
479 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  50.4 
 
 
414 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.67 
 
 
503 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  54.69 
 
 
457 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  53.44 
 
 
412 aa  363  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  52.43 
 
 
469 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.2 
 
 
478 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  53.44 
 
 
412 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  53.44 
 
 
412 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  53.87 
 
 
461 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  51.08 
 
 
399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  51.08 
 
 
399 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  51.08 
 
 
399 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  51.08 
 
 
399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  51.08 
 
 
399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  51.98 
 
 
493 aa  362  8e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  50.53 
 
 
409 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  53.17 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  53.17 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  53.17 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  53.32 
 
 
402 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.1 
 
 
411 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  53.32 
 
 
402 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  53.17 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.68 
 
 
470 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  53.17 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  56.72 
 
 
477 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.44 
 
 
463 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.35 
 
 
476 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  50.81 
 
 
399 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  50.54 
 
 
399 aa  359  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  50.54 
 
 
399 aa  358  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.53 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.34 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.67 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.67 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.7 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.7 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  54.32 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  48.12 
 
 
383 aa  356  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  52.38 
 
 
412 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  48.68 
 
 
409 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  49.36 
 
 
387 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  48.68 
 
 
409 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  52.17 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  53.5 
 
 
403 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  50.54 
 
 
400 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.88 
 
 
387 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  48.41 
 
 
399 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.22 
 
 
390 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.19 
 
 
466 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.59 
 
 
470 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  51.99 
 
 
485 aa  348  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  53.78 
 
 
407 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  48.75 
 
 
427 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.09 
 
 
492 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  52.76 
 
 
513 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  46.55 
 
 
417 aa  345  6e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>