50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0527 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2722  hypothetical protein  42.92 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.02 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  27.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  27.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  27.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  25.48 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.87 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  30.2 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  26.02 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08390  plasma membrane ammonium transporter (Ato3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01140)  23.58 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  25.77 
 
 		 189 aa  46.2  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.74 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  24.23 
 
 		 197 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.74 
 
 		 187 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  27.41 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 189 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  24.08 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.37 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  24.74 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  23.15 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  25.51 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  25.27 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.24 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  28.85 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.23 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  24.08 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  22.63 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  22.63 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  22.63 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  22.63 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  24.49 
 
 		 189 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.15 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.15 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.77 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>