40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3523 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3523  Ribosomal protein L25-like protein  100 
 
 
98 aa  199  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2054  50S ribosomal protein L25  84.38 
 
 
99 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3283  50S ribosomal protein L25  63.83 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228774  normal  0.044405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4741  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  60.2 
 
 
198 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0736  50S ribosomal protein L25  59.57 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0707  50S ribosomal protein L25  58.51 
 
 
108 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2531  50S ribosomal protein L25  59.38 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2003  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  41.03 
 
 
208 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000475903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2818  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.16 
 
 
217 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3653  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.66 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00224871  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1454  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.49 
 
 
218 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0673  ribosomal protein L25  32.61 
 
 
94 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_002950  PG0167  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.9 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0896  50S ribosomal protein L25P  36.46 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.220682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1674  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.67 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2415  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  31 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.203941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1041  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.26 
 
 
201 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000685221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1377  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.9 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0448782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0346  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  32.04 
 
 
228 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.246778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0426  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.9 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122044  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1232  ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)  30.49 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0660333  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1255  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.27 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0112438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0078  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.31 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.514827  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1127  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.77 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4754  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.59 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0446761  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1103  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  36.14 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1156  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1472  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  31.91 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.294913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1635  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  31.03 
 
 
205 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1070  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.12 
 
 
218 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.50901  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0943  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  37.21 
 
 
204 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293242  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0070  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32 
 
 
211 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.704852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0765  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0677  50S ribosomal protein L25P  32.32 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4539  50S ribosomal protein L25P  29.59 
 
 
233 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000207822  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2145  ribosomal protein L25  30.77 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1803  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  30.77 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1057  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.8 
 
 
202 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0348708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3628  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.33 
 
 
200 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4462  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  37.33 
 
 
198 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>