34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4214 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4214  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
155 aa  317  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.99 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.18 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.9 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.82 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  38.18 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  38.18 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  36.07 
 
 
126 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.85 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.85 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  32.73 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  38.18 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.91 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.55 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.19 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  36.36 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.18 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  32.08 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>