298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0015 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0015  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0064  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.373773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0028  tRNA-Glu  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0045  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0001  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0034  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu01  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.484379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu02  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu03  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0047  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0034  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00296097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0050  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.517089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0038  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.012292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0037  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0053  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159981  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0020  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>