36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1286 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  33.9 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  28.76 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4068  Phage-related protein endonuclease-like  29.91 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  28.42 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  28.62 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  26.67 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  34.34 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  27.87 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  32.07 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  32.45 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  32.89 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  32.45 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  33.87 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2821  hypothetical protein  31.76 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0954368  normal  0.878787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1078  hypothetical protein  30.72 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000782333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  30.57 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1111  hypothetical protein  22.95 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00120065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2295  hypothetical protein  29.67 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441096  hitchhiker  0.0000000276618 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0305  hypothetical protein  22.95 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00109912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0556  hypothetical protein  21.65 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  27.65 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  29.03 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2345  hypothetical protein  29.13 
 
 		 543 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.740904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  29.59 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  28.5 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3823  phage-type endonuclease  30.21 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  27.55 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  29.73 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  24.48 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  25.5 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  31.31 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5740  phage-type endonuclease  27.17 
 
 		 211 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0694044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0783  exonuclease  27.22 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>