19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0260 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  94.51 
 
 		 1239 aa  1982    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 1238 aa  2294    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  59.69 
 
 		 1241 aa  1082    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  98.47 
 
 		 1238 aa  2266    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 1256 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 1256 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  27.52 
 
 		 1256 aa  105  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  20.11 
 
 		 1225 aa  95.5  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1253 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 		 1431 aa  84.7  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1433 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1433 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  19.57 
 
 		 1257 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 		 1379 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1338 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1042 aa  53.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  25.41 
 
 		 616 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 1096 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  26.12 
 
 		 632 aa  45.8  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>