12 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mpal_0535  CDS  NC_011832  535219  535665  447  30S ribosomal protein S19e  YP_002465631  unclonable  1.47139e-06  normal  0.911419  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_0536  CDS  NC_011832  535681  536010  330  hypothetical protein  YP_002465632  unclonable  9.85959e-07  normal  0.911419  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_0700  CDS  NC_011832  698050  699429  1380  hypothetical protein  YP_002465790  unclonable  3.92542e-05  normal  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_0739  CDS  NC_011832  738795  741428  2634  PKD domain containing protein  YP_002465826  unclonable  0.000357401  normal  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_0765  CDS  NC_011832  777802  779811  2010  UvrD/REP helicase  YP_002465850  unclonable  5.86014e-05  normal  0.102674  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_0921  CDS  NC_011832  948153  951161  3009  hypothetical protein  YP_002465997  unclonable  0.000970429  normal  0.0907486  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1185  CDS  NC_011832  1219064  1221037  1974  DNA polymerase I  YP_002466248  unclonable  6.74312e-05  normal  0.200661  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1186  CDS  NC_011832  1221037  1221261  225  hypothetical protein  YP_002466249  unclonable  6.67317e-07  normal  0.250187  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1187  CDS  NC_011832  1221261  1221794  534  replication control protein A, putative  YP_002466250  unclonable  1.51673e-06  normal  0.258726  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1473  CDS  NC_011832  1521298  1523457  2160  Carbohydrate binding family 6  YP_002466518  unclonable  9.67191e-05  normal  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1961  CDS  NC_011832  2080236  2082758  2523  Carbohydrate binding family 6  YP_002466987  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Mpal_1962  CDS  NC_011832  2083155  2083622  468  protein of unknown function DUF82  YP_002466988  unclonable  3.51454e-06  decreased coverage  0.00501017  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>