48 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
YpAngola_0109  CDS  NC_010158  87911  90277  2367  cobT family protein  YP_001604619  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0110  CDS  NC_010158  90387  90599  213  hypothetical protein  YP_001604620  hitchhiker  6.02223e-111  unclonable  5.44391e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0112    NC_010158  90862  91248  387      unclonable  1.05078e-112  hitchhiker  7.41412e-138  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0301  CDS  NC_010159  319227  319442  216  30S ribosomal protein S21  YP_001604918  unclonable  9.15609e-13  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0302  CDS  NC_010159  319578  321326  1749  DNA primase  YP_001604919  unclonable  1.95537e-10  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0321  CDS  NC_010159  335873  336400  528  flavodoxin FldA  YP_001604935  unclonable  4.60147e-12  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0410  CDS  NC_010159  425588  426967  1380  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001605016  unclonable  1.34785e-10  hitchhiker  0.000369784  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0444  CDS  NC_010159  465979  466518  540  attachment invasion locus protein  YP_001605049  unclonable  1.96272e-12  hitchhiker  7.3955e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0755  CDS  NC_010159  767150  768556  1407  replicative DNA helicase  YP_001605331  unclonable  9.03078e-11  normal  0.0879158  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1105  CDS  NC_010159  1144240  1145544  1305  putative hexuronate MFS transporter ExuT  YP_001605651  unclonable  9.98284e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1106  CDS  NC_010159  1145807  1146601  795  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  YP_001605652  unclonable  2.40199e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1211  CDS  NC_010159  1259378  1260445  1068  tRNA-dihydrouridine synthase B  YP_001605752  unclonable  5.4155e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1378  CDS  NC_010159  1434864  1435442  579  heat shock protein GrpE  YP_001605904  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1658  CDS  NC_010159  1712903  1714984  2082  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  YP_001606158  unclonable  8.81395e-10  normal  0.485091  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1659  CDS  NC_010159  1715206  1715484  279  hypothetical protein  YP_001606159  unclonable  1.55874e-12  normal  0.221825  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1660  CDS  NC_010159  1715706  1716545  840  23S rRNA methyltransferase A  YP_001606160  unclonable  8.47833e-12  normal  0.340035  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1661  CDS  NC_010159  1716919  1717674  756  hypothetical protein  YP_001606161  unclonable  8.30855e-12  normal  0.376389  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1662  CDS  NC_010159  1718017  1718133  117  hypothetical protein  YP_001606162  unclonable  1.54288e-12  normal  0.321948  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1768  CDS  NC_010159  1831583  1832464  882  threonine and homoserine efflux system  YP_001606257  unclonable  2.70946e-11  normal  0.0166943  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1769  CDS  NC_010159  1832480  1832977  498  acetyltransferase  YP_001606258  unclonable  6.86927e-12  normal  0.0139792  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1852  CDS  NC_010159  1920130  1921332  1203  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  YP_001606339  unclonable  6.48798e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1942  CDS  NC_010159  2014794  2015312  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001606416  unclonable  5.34857e-12  normal  0.179593  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A1943  CDS  NC_010159  2015381  2017132  1752  hypothetical protein  YP_001606417  unclonable  2.94909e-10  normal  0.195502  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2054  CDS  NC_010159  2141382  2141930  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001606523  unclonable  5.03595e-12  hitchhiker  0.00039337  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2055  tRNA  NC_010159  2142075  2142150  76  tRNA-Gly    unclonable  1.08601e-12  hitchhiker  0.000600208  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2056  tRNA  NC_010159  2142202  2142277  76  tRNA-Cys    unclonable  9.25021e-13  hitchhiker  0.000585084  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2057  tRNA  NC_010159  2142287  2142372  86  tRNA-Leu    unclonable  9.34529e-13  hitchhiker  0.00059391  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2058    NC_010159  2142513  2142737  225      unclonable  1.31446e-12  hitchhiker  0.000669909  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2059    NC_010159  2143296  2143523  228      unclonable  1.77553e-12  hitchhiker  0.000168119  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2625  CDS  NC_010159  2747746  2749674  1929  threonyl-tRNA synthetase  YP_001607032  unclonable  8.21618e-10  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2745  CDS  NC_010159  2870070  2871056  987  cell division protein ZipA  YP_001607139  unclonable  2.02555e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2799  tRNA  NC_010159  2932412  2932489  78  tRNA-Thr    unclonable  1.24978e-12  normal  0.096994  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2800  tRNA  NC_010159  2932507  2932591  85  tRNA-Tyr    unclonable  1.15343e-12  normal  0.0987715  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A2912  CDS  NC_010159  3058801  3059736  936  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001607290  unclonable  3.27717e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3055  CDS  NC_010159  3230475  3231779  1305  trigger factor  YP_001607421  unclonable  1.66473e-10  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3100  CDS  NC_010159  3275556  3276953  1398  multidrug efflux system protein MdtE  YP_001607464  unclonable  2.4134e-10  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3199  CDS  NC_010159  3390831  3391892  1062  outer membrane protein A  YP_001607555  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3242  CDS  NC_010159  3439055  3439741  687  DNA mismatch repair protein  YP_001607593  unclonable  1.70849e-11  normal  0.0183168  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3675  CDS  NC_010159  3898900  3901008  2109  elongation factor G  YP_001607995  unclonable  1.79981e-09  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3825  CDS  NC_010159  4059698  4060027  330  Z-ring-associated protein  YP_001608134  unclonable  2.3514e-12  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3974  CDS  NC_010159  4229722  4230033  312  50S ribosomal protein L21  YP_001608270  unclonable  2.70537e-12  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3975  CDS  NC_010159  4230053  4230310  258  50S ribosomal protein L27  YP_001608271  unclonable  2.19143e-12  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A3976  CDS  NC_010159  4230398  4231336  939  hypothetical protein  YP_001608272  unclonable  2.42668e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4178  CDS  NC_010159  4470966  4471106  141  50S ribosomal protein L34  YP_001608449  unclonable  3.72649e-12  normal  0.0228547  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4179  CDS  NC_010159  4471161  4471289  129  hypothetical protein  YP_001608450  unclonable  3.9985e-12  normal  0.0230304  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4180  CDS  NC_010159  4471371  4471484  114  ribonuclease P protein component  YP_001608451  unclonable  4.0396e-12  normal  0.023392  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4182  CDS  NC_010159  4471708  4473348  1641  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_001608452  unclonable  7.73413e-10  normal  0.0773458  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A4241  misc_RNA  NC_010159  4059461  4059642  182  6S / SsrS RNA    unclonable  1.28814e-12  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>