22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4180 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  100 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  100 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4180  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 37 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000040396  normal  0.023392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  91.89 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  83.78 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  83.78 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  83.78 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  83.78 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  81.08 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  80.56 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  72.22 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  54.84 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>