41 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dde_0142  CDS  NC_007519  133239  133547  309  hypothetical protein  YP_386638  unclonable  1.03365e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0143  CDS  NC_007519  133568  133663  96  hypothetical protein  YP_386639  unclonable  1.74041e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0144  CDS  NC_007519  133664  133804  141  hypothetical protein  YP_386640  unclonable  2.73022e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0145  CDS  NC_007519  133806  134729  924  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, solute-binding protein  YP_386641  unclonable  7.5973e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0560  CDS  NC_007519  582979  584499  1521  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_387056  unclonable  4.45569e-09  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0727  CDS  NC_007519  747495  749507  2013  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  YP_387223  unclonable  2.5266e-07  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0793  CDS  NC_007519  814098  814361  264  RNA-binding region RNP-1  YP_387289  unclonable  4.24033e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0880  CDS  NC_007519  910642  911595  954  hypothetical protein  YP_387376  unclonable  8.39852e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1011  CDS  NC_007519  1034001  1035347  1347  hypothetical protein  YP_387507  unclonable  6.69415e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1046  CDS  NC_007519  1074559  1075785  1227  cell division protein FtsA  YP_387542  unclonable  5.15882e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1139  CDS  NC_007519  1168679  1168846  168  hypothetical protein  YP_387635  unclonable  5.61341e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1140  CDS  NC_007519  1168904  1169638  735  hypothetical protein  YP_387636  unclonable  3.47629e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1141  CDS  NC_007519  1169638  1169820  183  hypothetical protein  YP_387637  unclonable  4.97737e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1142  CDS  NC_007519  1169937  1170158  222  hypothetical protein  YP_387638  unclonable  9.25736e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1185  CDS  NC_007519  1214202  1215827  1626  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  YP_387681  unclonable  6.66118e-09  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1222  CDS  NC_007519  1247840  1248415  576  rubrerythrin  YP_387718  unclonable  6.72055e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1279  CDS  NC_007519  1297115  1299301  2187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_387775  unclonable  5.58964e-07  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1320  CDS  NC_007519  1339453  1339950  498  rubrerythrin, putative  YP_387816  unclonable  3.83486e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1373  CDS  NC_007519  1393365  1393829  465  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_387869  unclonable  2.44394e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1374  CDS  NC_007519  1393831  1394616  786  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  YP_387870  unclonable  2.70452e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1413  CDS  NC_007519  1430377  1432710  2334  organic solvent tolerance protein, putative  YP_387907  unclonable  1.19943e-06  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1442  CDS  NC_007519  1466697  1467659  963  signal peptide peptidase A  YP_387936  unclonable  1.19274e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1479  CDS  NC_007519  1498823  1499860  1038  CBS  YP_387973  unclonable  1.61298e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1513  CDS  NC_007519  1532051  1534048  1998  FtsH peptidase  YP_388007  unclonable  9.7295e-08  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1618  CDS  NC_007519  1667691  1668290  600  flavodoxin-like fold domain-containing protein  YP_388110  unclonable  5.95904e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1689  CDS  NC_007519  1740755  1741813  1059  OmpA family protein  YP_388181  unclonable  1.95152e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1755  CDS  NC_007519  1811437  1813254  1818  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_388247  unclonable  3.6302e-08  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1791  CDS  NC_007519  1842056  1842616  561  ferritin  YP_388283  unclonable  5.12633e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1893  CDS  NC_007519  1944974  1947529  2556  ATPase, E1-E2 type  YP_388385  unclonable  4.8497e-06  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_1973  CDS  NC_007519  2018771  2019271  501  HIT family protein  YP_388465  unclonable  1.82824e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2017  CDS  NC_007519  2059273  2059401  129  hypothetical protein  YP_388509  unclonable  1.12031e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2034  CDS  NC_007519  2075331  2076215  885  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_388526  unclonable  1.6391e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2371  CDS  NC_007519  2394087  2395448  1362  sodium-dependent symporter family protein  YP_388863  unclonable  1.33814e-09  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2486  CDS  NC_007519  2505290  2508070  2781  excinuclease ABC subunit A  YP_388978  unclonable  1.02064e-05  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2524  CDS  NC_007519  2544697  2545332  636  nitroreductase-like  YP_389016  unclonable  5.39057e-12  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2525  CDS  NC_007519  2545720  2546670  951  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_389017  unclonable  3.54745e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2526  CDS  NC_007519  2546740  2546904  165  hypothetical protein  YP_389018  unclonable  1.45334e-13  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2626  CDS  NC_007519  2640953  2643364  2412  ATP-dependent protease, putative  YP_389117  unclonable  2.39913e-06  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_2627  CDS  NC_007519  2643404  2644267  864  hypothetical protein  YP_389118  unclonable  1.47338e-10  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_3117  CDS  NC_007519  3108090  3109004  915  hypothetical protein  YP_389606  unclonable  5.45618e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_3555  CDS  NC_007519  3515696  3516511  816  zinc transporter ZupT  YP_390043  unclonable  2.23536e-11  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>