37 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tery_1230  CDS  NC_008312  1904238  1905296  1059  photosystem II D2 protein (photosystem q(a) protein)  YP_721054  unclonable  6.83761e-08  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1571  CDS  NC_008312  2402846  2404927  2082  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_721324  unclonable  6.0483e-05  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1805  CDS  NC_008312  2753595  2754209  615  hypothetical protein  YP_721535  normal  unclonable  4.8787e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_1806  CDS  NC_008312  2754328  2755920  1593  methionyl-tRNA synthetase  YP_721536  normal  unclonable  5.79293e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2112  CDS  NC_008312  3298305  3299189  885  UDP-glucose pyrophosphorylase  YP_721821  unclonable  5.48517e-08  normal  0.537185  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2325  CDS  NC_008312  3599249  3599467  219  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_722020  decreased coverage  7.40835e-09  unclonable  2.03995e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2326  CDS  NC_008312  3600515  3601087  573  hypothetical protein  YP_722021  normal  0.0136683  unclonable  2.49209e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2327  CDS  NC_008312  3601653  3603533  1881  arsenite-activated ATPase ArsA  YP_722022  normal  0.761686  unclonable  4.3688e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2474  CDS  NC_008312  3805467  3807194  1728  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_722156  unclonable  5.57801e-06  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2618  CDS  NC_008312  4043562  4045433  1872  GUN4-like  YP_722286  unclonable  1.89308e-05  normal  0.347807  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_2809  CDS  NC_008312  4358134  4361091  2958  tetratricopeptide TPR_2  YP_722458  unclonable  0.00683217  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3031  CDS  NC_008312  4679856  4681199  1344  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  YP_722655  normal  0.542337  unclonable  3.10655e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3151  CDS  NC_008312  4808487  4810391  1905  ATPase AAA-2  YP_722754  hitchhiker  0.000310841  unclonable  4.97822e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3152  CDS  NC_008312  4810705  4811034  330  hypothetical protein  YP_722755  unclonable  2.95489e-09  unclonable  3.04444e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3300    NC_008312  5061694  5061903  210      unclonable  5.39704e-10  decreased coverage  0.00665451  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3352  CDS  NC_008312  5142563  5143429  867  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_722927  unclonable  2.22923e-08  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3932  CDS  NC_008312  6076051  6078795  2745  WD-40 repeat-containing protein  YP_723436  normal  0.237365  unclonable  6.34097e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3933  CDS  NC_008312  6079121  6080560  1440  hypothetical protein  YP_723437  normal  0.218593  unclonable  4.03133e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3934  CDS  NC_008312  6080614  6085413  4800  WD-40 repeat-containing protein  YP_723438  normal  0.146607  unclonable  0.000100505  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_3936  CDS  NC_008312  6087348  6090377  3030  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  YP_723440  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4064  CDS  NC_008312  6276393  6276809  417  thioesterase superfamily protein  YP_723549  normal  unclonable  5.08078e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4065    NC_008312  6277513  6278315  803      normal  unclonable  5.45345e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4066  CDS  NC_008312  6278855  6279109  255  hypothetical protein  YP_723550  normal  0.502822  unclonable  5.02924e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4067  CDS  NC_008312  6279994  6281409  1416  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  YP_723551  normal  0.846169  unclonable  7.22409e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4068  CDS  NC_008312  6281793  6282737  945  O-succinylbenzoate synthase  YP_723552  normal  unclonable  5.91111e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4069  CDS  NC_008312  6283409  6284266  858  alpha/beta hydrolase fold  YP_723553  normal  unclonable  5.34337e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4070  CDS  NC_008312  6284592  6284990  399  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_723554  normal  unclonable  4.3688e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4071  CDS  NC_008312  6285411  6286307  897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  YP_723555  normal  unclonable  5.5647e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4072  CDS  NC_008312  6286709  6288205  1497  isochorismate synthases  YP_723556  normal  0.108156  unclonable  6.87043e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4073    NC_008312  6288606  6289677  1072      normal  unclonable  5.34337e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4074    NC_008312  6289940  6290182  243      normal  unclonable  3.99044e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4075  CDS  NC_008312  6290196  6290903  708  hypothetical protein  YP_723557  normal  0.982265  unclonable  4.32448e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4076  CDS  NC_008312  6290967  6291212  246  hypothetical protein  YP_723558  normal  0.895423  unclonable  3.71993e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4077  CDS  NC_008312  6291504  6293252  1749  2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3- cyclohexene-1-carboxylate synthase  YP_723559  normal  unclonable  5.13285e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4237  CDS  NC_008312  6542893  6546090  3198  helicase-like  YP_723710  unclonable  0.00803691  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_4806  CDS  NC_008312  7388112  7390736  2625  alanyl-tRNA synthetase  YP_724229  unclonable  0.00251805  normal  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Tery_R0017  rRNA  NC_008312  3139115  3141995  2881  23S ribosomal RNA    unclonable  0.00563866  normal  0.094842  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>