24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1777 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  99.46 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  25.57 
 
 		 333 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  25.6 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  25.57 
 
 		 333 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  25.6 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  25.57 
 
 		 333 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  32.94 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  26.74 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  27.67 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  27.67 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  27.91 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  27.55 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  21.51 
 
 		 254 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  29.35 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  22.69 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  24.71 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  27.96 
 
 		 343 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  24.73 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  27.17 
 
 		 342 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  26.67 
 
 		 336 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  34.69 
 
 		 266 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>