30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0526 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  99.46 
 
 
1117 aa  2309    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  99.36 
 
 
1095 aa  2260    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  38.37 
 
 
1113 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  100 
 
 
1117 aa  2322    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  34.71 
 
 
1169 aa  619  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  35.22 
 
 
1076 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  33.69 
 
 
1136 aa  589  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  32.78 
 
 
1145 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  33.67 
 
 
1094 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  32.97 
 
 
1100 aa  556  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  35.28 
 
 
1195 aa  326  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  23.65 
 
 
2870 aa  70.1  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  22.15 
 
 
2716 aa  69.3  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  21.41 
 
 
2823 aa  64.7  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  24.88 
 
 
849 aa  63.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  22.44 
 
 
2747 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  22.04 
 
 
2922 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  22.7 
 
 
2880 aa  60.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  22.7 
 
 
2758 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  22.12 
 
 
2786 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  22.49 
 
 
2748 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  21.19 
 
 
2748 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  22.74 
 
 
2779 aa  51.6  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  21.59 
 
 
624 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  21.6 
 
 
2929 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  23.1 
 
 
1303 aa  48.5  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  22.58 
 
 
2842 aa  47  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  21.67 
 
 
2845 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  22.51 
 
 
2833 aa  45.8  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  18.49 
 
 
2887 aa  45.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>