23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0952 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1057    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  92.97 
 
 		 512 aa  967    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  98.63 
 
 		 510 aa  1045    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  34.44 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  71.57 
 
 		 371 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0797  PAAR domain-containing protein  78.26 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2991  PAAR domain-containing protein  76.09 
 
 		 352 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2589  hypothetical protein  75 
 
 		 352 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2921  putative Pyocin large subunit  55.32 
 
 		 191 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  31.48 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  47.62 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5071  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  26 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  27.07 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  26.84 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  24.93 
 
 		 546 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  30.54 
 
 		 791 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  52.17 
 
 		 137 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  24.7 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  32.59 
 
 		 133 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 93 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 		 87 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  37.23 
 
 		 87 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>