More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1124 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  66.03 
 
 		 469 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  64.24 
 
 		 471 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  64.24 
 
 		 471 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  64.81 
 
 		 472 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  63.46 
 
 		 469 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  63.03 
 
 		 469 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 		 469 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 469 aa  675    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  64.03 
 
 		 471 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  63.89 
 
 		 469 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  63.68 
 
 		 469 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  87.37 
 
 		 467 aa  877    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  64.03 
 
 		 471 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  63.68 
 
 		 469 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 469 aa  980    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  65.59 
 
 		 471 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  65.38 
 
 		 471 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  63.66 
 
 		 468 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  64.53 
 
 		 469 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  64.53 
 
 		 469 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  634    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  85.07 
 
 		 469 aa  856    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  63.58 
 
 		 471 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  64.32 
 
 		 469 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  63.52 
 
 		 471 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  98.51 
 
 		 469 aa  963    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  63.89 
 
 		 469 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  64.1 
 
 		 469 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  62.18 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  63.6 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  62.96 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  63.38 
 
 		 471 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  63.38 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  63.89 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  62.74 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  62.96 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  63.99 
 
 		 467 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  64.5 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  62.31 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  62.88 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  62.96 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  64.5 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  63.26 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  63.6 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  63.52 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  61.97 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  63.6 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  62.1 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  61.88 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0412  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0305  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  63.68 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  63.03 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  63.46 
 
 		 469 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  62.31 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  62.18 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0311  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4410  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0307  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  62.39 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  62.31 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0306  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0311  glutamine synthetase  63.25 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  62.1 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  62.99 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  61.11 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  61.11 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3454  glutamine synthetase  62.61 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00170098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  61.54 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  61.11 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  62.34 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>