28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0072 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  355  2e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  62.33 
 
 
198 aa  177  5e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  59.21 
 
 
213 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  59.74 
 
 
200 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  58.54 
 
 
330 aa  174  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  2.4836e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  61.33 
 
 
203 aa  171  4e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  57.55 
 
 
268 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  50.32 
 
 
280 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  51.32 
 
 
275 aa  146  1e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  51.57 
 
 
264 aa  145  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  51.57 
 
 
214 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  49.03 
 
 
280 aa  145  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  55.22 
 
 
272 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  48.73 
 
 
263 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  132  4e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  3.59557e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  51.88 
 
 
283 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  46.67 
 
 
376 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  43.84 
 
 
378 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  43.84 
 
 
378 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  43.7 
 
 
374 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  40.65 
 
 
384 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  43.15 
 
 
379 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  39.63 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  46.56 
 
 
157 aa  94.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  45.8 
 
 
237 aa  87.8  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  36.5 
 
 
348 aa  81.3  8e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  63.2  2e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5830  hypothetical protein  29.32 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>