27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1533 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  90.48 
 
 		 378 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  90.74 
 
 		 378 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  57.71 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  55.64 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  50.81 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  40.28 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  42.04 
 
 		 330 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  40.91 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  42.13 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  42.04 
 
 		 203 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  38.93 
 
 		 282 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  39.51 
 
 		 213 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  43.15 
 
 		 180 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  36.49 
 
 		 214 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  36.49 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  43.8 
 
 		 280 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  43.8 
 
 		 280 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  38.82 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  42.03 
 
 		 188 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  41.61 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  39.58 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  28.79 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>