23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0895 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  39.04 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  36.75 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  36.94 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  33.85 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  32.95 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  28.96 
 
 
376 aa  72  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  30.73 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  37.78 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  35.85 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  33.83 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  31.68 
 
 
374 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  35.03 
 
 
203 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  28.79 
 
 
379 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  29.46 
 
 
378 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  30.62 
 
 
378 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  32.09 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  31.43 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  32.38 
 
 
263 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  38.98 
 
 
348 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>