25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5510 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 89 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  91.01 
 
 		 89 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  87.64 
 
 		 89 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.5 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.5 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  63.33 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  56.41 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  56.41 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  56.41 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.69 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.35 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15560  hypothetical protein  79.41 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000160918  unclonable  2.1203199999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  74.29 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.37 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.5 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  33.72 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  38.3 
 
 		 138 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2093  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267606  normal  0.329049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>