98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5249 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5249  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
140 aa  293  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000066738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3922  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.97 
 
 
140 aa  201  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.91 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.91 
 
 
135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.19 
 
 
143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.225556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  63.57 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.07 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  61.42 
 
 
139 aa  169  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.92 
 
 
138 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.384349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.84 
 
 
136 aa  159  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0884079  normal  0.141293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4098  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.97 
 
 
139 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.03 
 
 
141 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.96 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
138 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.94 
 
 
137 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  56.92 
 
 
135 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.96 
 
 
134 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0265645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0020  hypothetical protein  63.91 
 
 
137 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.528781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4348  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.54 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08170  predicted lactoylglutathione lyase  52.67 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.913162  normal  0.0778281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2354  hypothetical protein  50.77 
 
 
134 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2565  hypothetical protein  51.59 
 
 
132 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2632  hypothetical protein  50.79 
 
 
132 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1430  hypothetical protein  48.85 
 
 
132 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2740  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.91 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0232716  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.12 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.62 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0443  hypothetical protein  48.82 
 
 
135 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.864422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 
138 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1706  lactoylglutathione lyase-like protein  49.21 
 
 
136 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.34 
 
 
135 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.990227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1009  hypothetical protein  44.2 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1060  hypothetical protein  51.24 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3250  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.91 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.395737  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.85 
 
 
138 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1263  hypothetical protein  48.12 
 
 
137 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1709  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.09 
 
 
135 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.74 
 
 
138 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.7 
 
 
134 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.74 
 
 
138 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.74 
 
 
138 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2857  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.31 
 
 
144 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000230287  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2327  lactoylglutathione lyase  46.46 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200083  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0419  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.03 
 
 
133 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  43.85 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
141 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1780  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
135 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630756  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
144 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6209  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.66 
 
 
147 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.954751  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 
135 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1420  hypothetical protein  40.31 
 
 
137 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0362155  normal  0.0872758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.53 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4499  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0899867  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3489  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.990759  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4147  putative glyoxalase family protein  44.95 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2818  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4393  glyoxalase/bleomycin resistance protein dioxygenase superfamily protein  30.77 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1441  hypothetical protein  28.36 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2038  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.697141  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
142 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  28.26 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  32.52 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.91 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.21 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21560  predicted lactoylglutathione lyase  25 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1165  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
149 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0390  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0279674  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.8 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1945  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869019  hitchhiker  0.00300875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
143 aa  43.9  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2048  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3902  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  26.02 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3394  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0097  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.24 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.530776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324521  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3047  lactoylglutathione lyase  26.61 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2697  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58620  hypothetical protein  27.21 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0225387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>