70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0844 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  192  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  54.55 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  47.25 
 
 
91 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  43.96 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  37.08 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  31.4 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  29.73 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  28.74 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  22.78 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  29.89 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  26.83 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  28.05 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  26.51 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  25.56 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  32.35 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  26.51 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  26.51 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  26.83 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  25.29 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  26.51 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  26.25 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  25.93 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  29.17 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  31.71 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  25.93 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  24.72 
 
 
123 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  26.83 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  23.33 
 
 
96 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  27.91 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  26.44 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  28.38 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03959  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  25.61 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3865  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03998  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  23.33 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4368  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.337013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3900  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4595  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4681  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5642  hypothetical protein  28.21 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  23.75 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  25.84 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  25 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0308  acetyltransferase-like protein  24.72 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  30.38 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  30.38 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  28.3 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  25.56 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  28.75 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  20.88 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  24.71 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  28.3 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3304  hypothetical protein  27.71 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  22.97 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
96 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  31.43 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  21.59 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  26.25 
 
 
79 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  34.69 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  30 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  28.21 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  28.4 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  28 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  23.33 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>