36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3161t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3161t  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2916  tRNA-Val  95.52 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0850846  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0092  tRNA-Val  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0448761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Val-1  tRNA-Val  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0259741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0023  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0023  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.756244  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr03  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>