274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0001 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  56.52 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  55.8 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  55.4 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  49.64 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  48.25 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  48.25 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  48.25 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  48.2 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.85 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  47.55 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  48.23 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  47.52 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  46.15 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  47.52 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  43.36 
 
 		 147 aa  137  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  46.1 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  43.36 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  45.45 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  45.45 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  45.45 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  46.76 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  43.36 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  46.81 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  42.66 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  44.76 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.76 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  44.76 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  44.76 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  44.76 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  42.66 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  45.45 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  43.26 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  44.68 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  45.71 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  46.1 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  43.97 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  44.68 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  43.97 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.36 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  43.97 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  42.55 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  42.55 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  42.14 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.76 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.2 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  39.62 
 
 		 165 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  33.1 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  33.1 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  33.1 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  31.47 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.1 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  33.1 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  34.72 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  31.25 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  30.5 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  30.99 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  30.56 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  29.79 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  30.99 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.79 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  30.34 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  30.56 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  30.77 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  30 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  30.56 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  30.56 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  31.91 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  28.17 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  31.91 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  32.62 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  30 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  29.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  29.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  29.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  31.94 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  30.71 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  28.57 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  28.87 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  28.87 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  26.57 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  26.53 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  28.87 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  28.87 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  27.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  27.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  27.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  28.87 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.68 
 
 		 735 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  26.06 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  26.06 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  26.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  35.56 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  32.88 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.29 
 
 		 588 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  26.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  29.29 
 
 		 588 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>