111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002580 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002580  glucosamine kinase GpsK  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03429  hypothetical protein  93.54 
 
 
296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  77.16 
 
 
294 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  69.34 
 
 
291 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0709  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  43.25 
 
 
297 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  44.44 
 
 
303 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3677  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.36 
 
 
302 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.57 
 
 
299 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3528  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.07 
 
 
304 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.14 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.54 
 
 
295 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  37.98 
 
 
295 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  37.98 
 
 
295 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  34.86 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.69 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.31 
 
 
299 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.26 
 
 
294 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  35.37 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.85 
 
 
298 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  35.23 
 
 
297 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.57 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.29 
 
 
302 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.29 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.93 
 
 
302 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.92 
 
 
311 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.92 
 
 
311 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  33.8 
 
 
300 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.92 
 
 
311 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  32.86 
 
 
288 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  32.86 
 
 
288 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.57 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.17 
 
 
289 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00859  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.42 
 
 
304 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.81 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1212  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.25 
 
 
298 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000148671  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.1 
 
 
300 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.62 
 
 
299 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.22 
 
 
318 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.64 
 
 
308 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.86 
 
 
327 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.12 
 
 
298 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.98 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.4 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.89 
 
 
277 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  29.96 
 
 
296 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  29.96 
 
 
296 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.15 
 
 
311 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.15 
 
 
311 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.15 
 
 
311 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.15 
 
 
311 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.15 
 
 
311 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  29.24 
 
 
296 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.62 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.7 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.89 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.52 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.89 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.89 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.62 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.89 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.52 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  29.2 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.95 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3676  hypothetical protein  34.43 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0710  hypothetical protein  35.48 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2598  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.55 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3527  hypothetical protein  34.15 
 
 
183 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  26.82 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.11 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.11 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  25.97 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  27.17 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.48 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.08 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  25.19 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  26.81 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  25.95 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  25.19 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.98 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  25.57 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.71 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.74 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  26.61 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.08 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.38 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  23.33 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.46 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.65 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  27.34 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
296 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.89 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2130  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.3 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.31 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.13 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.39 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>