More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001542 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  60 
 
 		 538 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  65.05 
 
 		 535 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  67.48 
 
 		 535 aa  765    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  66.92 
 
 		 535 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  68.97 
 
 		 535 aa  780    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  66.54 
 
 		 535 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  69.35 
 
 		 535 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  67.66 
 
 		 535 aa  771    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  60.75 
 
 		 535 aa  690    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  69.16 
 
 		 535 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  66.79 
 
 		 535 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  66.17 
 
 		 535 aa  730    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  65.98 
 
 		 535 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1170  propionyl-CoA carboxylase  62.31 
 
 		 558 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  66.17 
 
 		 535 aa  730    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  65.86 
 
 		 535 aa  740    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  65.86 
 
 		 535 aa  726    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  62.13 
 
 		 535 aa  680    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  66.42 
 
 		 535 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  67.42 
 
 		 536 aa  751    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  66.04 
 
 		 535 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  66.23 
 
 		 534 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 541 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  65.23 
 
 		 546 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  65.05 
 
 		 535 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  60.37 
 
 		 535 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  61.45 
 
 		 534 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  65.61 
 
 		 535 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  69.53 
 
 		 535 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  62.13 
 
 		 535 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  67.29 
 
 		 535 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  63.69 
 
 		 535 aa  706    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2508  methylcrotonyl-CoA carboxylase beta chain  62.13 
 
 		 558 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  66.23 
 
 		 535 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  65.18 
 
 		 535 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  64.81 
 
 		 540 aa  725    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  64.01 
 
 		 535 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  65.61 
 
 		 535 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  66.17 
 
 		 535 aa  736    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2011  propionyl-CoA carboxylase  63.25 
 
 		 534 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1527  propionyl-CoA carboxylase  59.33 
 
 		 557 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  62.08 
 
 		 534 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  66.17 
 
 		 535 aa  730    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  59.48 
 
 		 537 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1145  propionyl-CoA carboxylase  64.72 
 
 		 508 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.992894  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  64.67 
 
 		 535 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  59.51 
 
 		 529 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  63.84 
 
 		 540 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  60.71 
 
 		 534 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  66.92 
 
 		 535 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  63.93 
 
 		 535 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  69.55 
 
 		 553 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  60.58 
 
 		 553 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1300  propionyl-CoA carboxylase  64.83 
 
 		 534 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122048  normal  0.144625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  65.86 
 
 		 535 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  69.92 
 
 		 552 aa  785    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  62.06 
 
 		 535 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05479  propionyl-CoA carboxylase subunit beta  85.58 
 
 		 534 aa  973    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  62.17 
 
 		 534 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  61.5 
 
 		 547 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  68.54 
 
 		 536 aa  760    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  65.31 
 
 		 535 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  65.61 
 
 		 535 aa  744    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  69.35 
 
 		 535 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  67.48 
 
 		 536 aa  753    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  66.17 
 
 		 535 aa  730    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  60.3 
 
 		 533 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  63.81 
 
 		 534 aa  697    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  61.68 
 
 		 538 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1532  propionyl-CoA carboxylase  62.14 
 
 		 532 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  66.17 
 
 		 535 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  63.08 
 
 		 535 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  65.18 
 
 		 535 aa  729    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  65.24 
 
 		 554 aa  741    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  62.89 
 
 		 535 aa  695    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  65.61 
 
 		 535 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  68.77 
 
 		 535 aa  774    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  63.55 
 
 		 535 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  61.12 
 
 		 535 aa  694    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  69.72 
 
 		 535 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  69.53 
 
 		 535 aa  783    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  70.09 
 
 		 535 aa  796    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  61.31 
 
 		 535 aa  682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  69.35 
 
 		 535 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  65.86 
 
 		 535 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  69.53 
 
 		 535 aa  785    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  64.86 
 
 		 535 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  59.07 
 
 		 547 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  66.17 
 
 		 535 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  66.92 
 
 		 535 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  69.72 
 
 		 535 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4244  propionyl-CoA carboxylase  63.93 
 
 		 535 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  63.18 
 
 		 535 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  64.17 
 
 		 534 aa  711    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  63.04 
 
 		 535 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3637  propionyl-CoA carboxylase  63.5 
 
 		 534 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.742918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  60.67 
 
 		 535 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  61.22 
 
 		 535 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  69.72 
 
 		 535 aa  789    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  66.17 
 
 		 535 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>