234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0031 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0031  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  7.44729e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0043  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.80883e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0036  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.06131e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0015  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0027  tRNA-Val  96.05 
 
 
76 bp  127  4e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00584836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0017  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  94.74 
 
 
76 bp  119  1e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0011  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0033  tRNA-Val  93.42 
 
 
76 bp  111  2e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166955 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  93.15 
 
 
78 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0037  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599971  normal  0.116724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0022  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0016  tRNA-Val  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0267125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0023  tRNA-Val  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0696683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0037  tRNA-Val  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104744  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0053  tRNA-Val  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0032  tRNA-Val  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0382858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0050  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0032  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000419269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0050  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0050  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293545  normal  0.0134461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0021  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0415147  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0013  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557667  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0100  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0048  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0049  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.443386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0051  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0408927  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0058  tRNA-Val  89.04 
 
 
73 bp  81.8  2e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400004  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3351  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0607256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0039  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654664  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2123  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0023  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1953  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1228  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2359  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2318  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0283125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1167  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0042  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408267  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS02886  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.96324  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0022  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692684  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.752155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2476  tRNA-Val  88.16 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0026  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  2.63702e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0040  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  2.8212e-05  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R27  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.23391e-05  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0028  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0840048 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0027  tRNA-Val  88.16 
 
 
75 bp  71.9  2e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0026  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00233079  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0025  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  5.70702e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0038  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.20227e-15  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R36  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0020  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000221319  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0023  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.09055e-08  hitchhiker  3.50688e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R25  tRNA-Val  86.84 
 
 
76 bp  71.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112378  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  4.28882e-05  hitchhiker  6.92947e-09 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0070  tRNA-Val  87.32 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  95.35 
 
 
76 bp  69.9  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna41  tRNA-Val  86.84 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0020  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0249185  hitchhiker  0.00249648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0032  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0027  tRNA-Val  86.84 
 
 
75 bp  63.9  5e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0013  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.459697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0024  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal  0.339151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  85.53 
 
 
378 bp  63.9  5e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  85.53 
 
 
367 bp  63.9  5e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  85.53 
 
 
76 bp  63.9  5e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0020  tRNA-Val  85.71 
 
 
76 bp  60  8e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  9.15512e-06  hitchhiker  2.56884e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0915  tRNA-Val  85.71 
 
 
78 bp  60  8e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0054  tRNA-Val  85.71 
 
 
76 bp  60  8e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0048  tRNA-Val  85.71 
 
 
76 bp  60  8e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  87.1 
 
 
76 bp  60  8e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  87.1 
 
 
76 bp  60  8e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0004  tRNA-Val  85.71 
 
 
76 bp  60  8e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  3.88109e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0020  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0069  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0543632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0050  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.17049e-10  hitchhiker  1.86152e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0086  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.211919  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0079  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.80112e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0025  tRNA-Val  85.53 
 
 
75 bp  56  1e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0254254  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0035  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309036  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0078  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.94531e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0018  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0053  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0038  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0061  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.03181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0020  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  4.95031e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0084  tRNA-Val  84.21 
 
 
76 bp  56  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150766  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  92.31 
 
 
76 bp  54  5e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0040  tRNA-Val  97.14 
 
 
75 bp  54  5e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00170097  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  90.7 
 
 
76 bp  54  5e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.00863e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>