More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0109 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  100 
 
 
356 aa  719    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  64.62 
 
 
357 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  61.89 
 
 
357 aa  425  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  61.32 
 
 
357 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  56.5 
 
 
362 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  55.81 
 
 
355 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  56.09 
 
 
362 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  54.13 
 
 
370 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  52.99 
 
 
367 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  52.42 
 
 
367 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  52.71 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  52.14 
 
 
367 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  52.42 
 
 
367 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  51.85 
 
 
367 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  51.24 
 
 
375 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  49.43 
 
 
352 aa  358  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  51.68 
 
 
363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  50.42 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  52.71 
 
 
370 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  50.14 
 
 
358 aa  342  7e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  49.44 
 
 
361 aa  341  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  51.14 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  49.72 
 
 
353 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  49.14 
 
 
359 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  48.43 
 
 
362 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  48.58 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  48.3 
 
 
356 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  48.46 
 
 
361 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  48.3 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  45.48 
 
 
362 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  46.46 
 
 
358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  47.03 
 
 
356 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  42.62 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  45.35 
 
 
362 aa  299  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  42.94 
 
 
357 aa  298  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  47.01 
 
 
359 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  42.45 
 
 
368 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  42.17 
 
 
376 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  40.56 
 
 
366 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  41.19 
 
 
360 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  39.89 
 
 
372 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  41.97 
 
 
376 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  40.7 
 
 
370 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  33.83 
 
 
453 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  38.72 
 
 
372 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  34.83 
 
 
359 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  34.08 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  31.67 
 
 
333 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  30.83 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  28.12 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  27.83 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  26.03 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  25.59 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  25.73 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  25.36 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  25.84 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  26.86 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  25.94 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  28.85 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  27.54 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  27.27 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  25.88 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  26.74 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  25.61 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  34.76 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  26.42 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  26.76 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  28.87 
 
 
411 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.01 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  26.03 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  27.02 
 
 
583 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  26.32 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  27.67 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  25.51 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  27.67 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  28.46 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  28.46 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  25.35 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  27.67 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  28.69 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  27.67 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  27.06 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>