17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1653 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  100 
 
 		 189 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  40.48 
 
 		 146 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  37.78 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  34.11 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2590  hypothetical protein  38 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5255  normal  0.136566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  37.97 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  37.36 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  32.35 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  29.41 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  29.41 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  32.74 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  27.73 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  32.8 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  29.69 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>