20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2378 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  100 
 
 
407 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  46.48 
 
 
341 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  38.11 
 
 
345 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  38.1 
 
 
365 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  33.98 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01080  protein of unknown function (DUF916)  37.1 
 
 
378 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03550  protein of unknown function (DUF916)  39.83 
 
 
356 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1841  hypothetical protein  36.05 
 
 
292 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4774  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  38.21 
 
 
334 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2880  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  34.91 
 
 
366 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  38.56 
 
 
331 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2771  hypothetical protein  32.62 
 
 
348 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  32.27 
 
 
322 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0090  hypothetical protein  31.05 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8823  hypothetical protein  32.79 
 
 
388 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388128  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  27.31 
 
 
319 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1770  hypothetical protein  26.77 
 
 
359 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  29.29 
 
 
283 aa  47  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2985  hypothetical protein  30.46 
 
 
336 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3130  hypothetical protein  26.96 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>