17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1770 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1770  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3130  hypothetical protein  53.76 
 
 
314 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2985  hypothetical protein  44.92 
 
 
336 aa  248  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6894  hypothetical protein  47.89 
 
 
304 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3274  hypothetical protein  45.95 
 
 
353 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3533  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.731535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  27.48 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  27.85 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  27.91 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  34.59 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  28.28 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  26.72 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0090  hypothetical protein  28.37 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03550  protein of unknown function (DUF916)  27.36 
 
 
356 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8823  hypothetical protein  27.31 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388128  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2771  hypothetical protein  25.61 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  24.79 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>