20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2084 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  60.85 
 
 
272 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  64.66 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  42.35 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  42.05 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  30.94 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  32.5 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  31.78 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  32.5 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  32.61 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  32.61 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  32.61 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1641  hypothetical protein  24.49 
 
 
188 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  26.42 
 
 
208 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  23.66 
 
 
248 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  29.89 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  30.43 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>