18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0877 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  40.32 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  33.8 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0081  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  30.99 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  32.79 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  33.8 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  35.9 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  34.72 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  30.88 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0020  hypothetical protein  32.31 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0108405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  28.77 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0013  hypothetical protein  29.23 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237209 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>