More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0548 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  100 
 
 		 101 aa  212  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  51.46 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  50.47 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  50 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  50 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  51 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  50 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  50 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  49.04 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  47.96 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  46.32 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  45 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  46.81 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  46.67 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  44.44 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  44.44 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  44.44 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  48.04 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  48 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  43.93 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  47.12 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  44.44 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  44.55 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  43.14 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  41.58 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  43.43 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  40.4 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  46.46 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  49.45 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  41 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  39.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  48.35 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  43 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  42.16 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  41 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  41 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  41.35 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  40.78 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  42.42 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  39 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  40.4 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  39.39 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  37.76 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  37.86 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  39.42 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  40 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  42.42 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  36.73 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  36.08 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  36.36 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  36.73 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  35.71 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  36.73 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  36.73 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  37.11 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  37.61 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0184  BolA-like protein  34.44 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  37.36 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  36.36 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0782  BolA family protein  36.47 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  37.5 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  41.25 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  36.36 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  38.2 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  38.2 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  42.53 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  36.84 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  34.78 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  36.84 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  35.8 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  48.15 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  43.28 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  35.79 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0930  putative bolA protein  30 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.206894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  35.87 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  35.96 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  34.48 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  33.33 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  34.48 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  33.71 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  34.57 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  34.57 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  34.57 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  34.57 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>