More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0498 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  49.62 
 
 		 799 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  49.94 
 
 		 799 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  53.34 
 
 		 792 aa  771    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.84 
 
 		 796 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  53.96 
 
 		 780 aa  776    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  50.06 
 
 		 792 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.45 
 
 		 787 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  49.68 
 
 		 839 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  47.75 
 
 		 779 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.58 
 
 		 777 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  50.39 
 
 		 793 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.69 
 
 		 784 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.25 
 
 		 787 aa  749    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.85 
 
 		 801 aa  713    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.58 
 
 		 787 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.17 
 
 		 797 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.64 
 
 		 779 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  64.44 
 
 		 825 aa  1011    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.77 
 
 		 788 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  50.52 
 
 		 784 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.96 
 
 		 794 aa  769    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.43 
 
 		 799 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.58 
 
 		 787 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.07 
 
 		 797 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  65.21 
 
 		 825 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.98 
 
 		 793 aa  756    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  66.05 
 
 		 812 aa  1064    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.68 
 
 		 799 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.58 
 
 		 787 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.32 
 
 		 787 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.45 
 
 		 787 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.58 
 
 		 787 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.15 
 
 		 801 aa  698    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  50.32 
 
 		 802 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  64.33 
 
 		 825 aa  1009    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.09 
 
 		 788 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.57 
 
 		 812 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.2 
 
 		 788 aa  781    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  70.36 
 
 		 781 aa  1088    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  49.81 
 
 		 797 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.32 
 
 		 814 aa  688    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  46.56 
 
 		 856 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.17 
 
 		 788 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  51.04 
 
 		 783 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  46.19 
 
 		 800 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.19 
 
 		 808 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  100 
 
 		 782 aa  1608    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.05 
 
 		 764 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  52.5 
 
 		 777 aa  770    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  50.84 
 
 		 787 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  49.94 
 
 		 797 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.38 
 
 		 800 aa  732    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.72 
 
 		 779 aa  761    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  47.16 
 
 		 784 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  55.06 
 
 		 781 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  50.71 
 
 		 787 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.61 
 
 		 781 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  49.87 
 
 		 799 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  50.97 
 
 		 787 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.46 
 
 		 818 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.07 
 
 		 788 aa  779    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.97 
 
 		 787 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  53 
 
 		 770 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.44 
 
 		 816 aa  737    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.47 
 
 		 785 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.9 
 
 		 785 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.38 
 
 		 779 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.81 
 
 		 799 aa  732    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.58 
 
 		 784 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  49.87 
 
 		 798 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.94 
 
 		 823 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  50.07 
 
 		 799 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.11 
 
 		 801 aa  715    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.45 
 
 		 787 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.48 
 
 		 828 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  49.55 
 
 		 830 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.45 
 
 		 787 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.99 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.34 
 
 		 767 aa  633  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.51 
 
 		 804 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  46.07 
 
 		 767 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  39.59 
 
 		 1350 aa  507  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  38.81 
 
 		 769 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  38.49 
 
 		 1363 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  39.08 
 
 		 1387 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.61 
 
 		 754 aa  295  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  28.39 
 
 		 730 aa  288  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.68 
 
 		 753 aa  262  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0775  xanthine dehydrogenase, molybdenum-binding subunit, putative  28.3 
 
 		 752 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0918  Xanthine dehydrogenase  28.3 
 
 		 752 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2648  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  26.74 
 
 		 711 aa  227  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.65 
 
 		 782 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1169  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.72 
 
 		 771 aa  226  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.465724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.04 
 
 		 914 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3026  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.83 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.214024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02699  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit  26.83 
 
 		 752 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0826  Xanthine dehydrogenase  26.83 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3191  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.83 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0842  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  26.83 
 
 		 765 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02661  hypothetical protein  26.83 
 
 		 752 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>