19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11397 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  31.1 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  31.88 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  29.41 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  35.09 
 
 		 362 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  25.11 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  26.4 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  28.03 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  29.55 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  27.21 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  26.95 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  26.62 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.14 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  26.62 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  26.52 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.49 
 
 		 224 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  29.03 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>