15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2424 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  33.72 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  32.49 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  28.84 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  31.98 
 
 		 225 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  31.52 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  34.46 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  27.34 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  23.83 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  31.18 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  26.4 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  27.96 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  24.9 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  24.9 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2430  hypothetical protein  25.96 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.032964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>