41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2255 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  59.17 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  60.63 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  58.33 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  57.25 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  57.38 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  57.38 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  56.8 
 
 		 137 aa  143  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  50.4 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  47.15 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  46.34 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  50 
 
 		 145 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  54.05 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  51.72 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  48.8 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  51.72 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  49.19 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  50.86 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  46.22 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  49.55 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  49.55 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  49.19 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  48.65 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  50.81 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  44.19 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  40.19 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  40.91 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  41.12 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  37.9 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  36.29 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>