41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0991 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  100 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  91.87 
 
 		 123 aa  223  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  88.52 
 
 		 122 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  88.7 
 
 		 118 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  87.83 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  87.83 
 
 		 118 aa  199  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  81.3 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  87.72 
 
 		 116 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  79.67 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  83.62 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  83.62 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  80.33 
 
 		 122 aa  180  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  79.51 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  78.86 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  72.13 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  57.38 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  56.41 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  53.72 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  51.24 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  51.24 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  50.88 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  50.81 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  48.33 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  48.74 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  48.74 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  48.65 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  42.86 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  46.55 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  43.33 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  40.83 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  40.83 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  42.45 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  41.96 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  40.71 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>