20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4831 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  82.14 
 
 
140 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  80 
 
 
140 aa  241  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  78.1 
 
 
149 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  79.29 
 
 
140 aa  227  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  77.37 
 
 
149 aa  226  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  74.45 
 
 
149 aa  220  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  72.66 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  71.94 
 
 
150 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  71.22 
 
 
150 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  71.22 
 
 
150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  79.67 
 
 
150 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  77.69 
 
 
121 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  51.43 
 
 
140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  41.91 
 
 
140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  40.43 
 
 
162 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  45.3 
 
 
157 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1147  hypothetical protein  30.33 
 
 
156 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000230481  hitchhiker  0.0000000000000469186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>