More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1778 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  985    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  61 
 
 
472 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  61.56 
 
 
474 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  59.35 
 
 
469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  58.86 
 
 
465 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
478 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
488 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
473 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.7 
 
 
468 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
487 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
466 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
475 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
474 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
477 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
475 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
477 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  53.48 
 
 
481 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.1 
 
 
467 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
474 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
473 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
473 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
474 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  54.21 
 
 
466 aa  495  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
471 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
475 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
480 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  51.55 
 
 
462 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
470 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  52.19 
 
 
487 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
471 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
496 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  50.1 
 
 
470 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
462 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
465 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
493 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  51.36 
 
 
471 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
478 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
472 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
503 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
466 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
472 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
490 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
466 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
502 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  51.82 
 
 
494 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  51.82 
 
 
494 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
472 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
485 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
468 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
461 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
493 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
485 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  51.98 
 
 
478 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
488 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
485 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
488 aa  472  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
484 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
478 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
476 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
515 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
496 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  51.08 
 
 
503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
563 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
492 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
517 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
558 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
500 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  47.35 
 
 
511 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
515 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
467 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
488 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
479 aa  461  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
510 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
454 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
515 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
534 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
512 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 
467 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
527 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>