14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  100 
 
 		 271 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  56.72 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  60.39 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  50.74 
 
 		 310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  50.74 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  50.94 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  44.44 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  55.1 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  49.21 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  57.14 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  51.9 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  50 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  43.72 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  36.13 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>