25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2031 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  675    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  78.78 
 
 
365 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  42.81 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  43.07 
 
 
385 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  38.17 
 
 
407 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2880  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  43.87 
 
 
366 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4774  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  45.16 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03550  protein of unknown function (DUF916)  42.53 
 
 
356 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  44.72 
 
 
331 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2771  hypothetical protein  36.65 
 
 
348 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0090  hypothetical protein  37.58 
 
 
382 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  38.85 
 
 
322 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01080  protein of unknown function (DUF916)  37.6 
 
 
378 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1841  hypothetical protein  35.27 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8823  hypothetical protein  34.56 
 
 
388 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388128  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1770  hypothetical protein  26.64 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3274  hypothetical protein  30.3 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2985  hypothetical protein  26.35 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3533  hypothetical protein  29.59 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.731535 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  25.38 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  28 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6894  hypothetical protein  27.33 
 
 
304 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3130  hypothetical protein  28.12 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1627  hypothetical protein  24.51 
 
 
543 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0332  hypothetical protein  25.49 
 
 
383 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000474968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>