More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0467 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1139    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  41.03 
 
 		 1110 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  38.74 
 
 		 1105 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  48.11 
 
 		 855 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  46.97 
 
 		 366 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  47.49 
 
 		 653 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  42.32 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  47.31 
 
 		 678 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  48.26 
 
 		 664 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  47.35 
 
 		 321 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  45.06 
 
 		 348 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  37.26 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  47.74 
 
 		 379 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  42.5 
 
 		 1930 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  49.58 
 
 		 344 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  44.84 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.76 
 
 		 331 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  45.79 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  44.31 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  44.31 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  44.76 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  42.64 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  45.26 
 
 		 839 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  49.17 
 
 		 344 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 		 298 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  44.32 
 
 		 329 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  45.04 
 
 		 310 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  45.24 
 
 		 846 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  45.95 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  45.95 
 
 		 341 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  45.94 
 
 		 780 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  44.67 
 
 		 617 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  40.29 
 
 		 487 aa  203  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  45.45 
 
 		 466 aa  203  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  44.4 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  44.14 
 
 		 681 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  45.39 
 
 		 802 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  43.96 
 
 		 819 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  42.86 
 
 		 318 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  43.94 
 
 		 354 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  41.86 
 
 		 365 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  40.43 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  47.17 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  37.42 
 
 		 334 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  43.87 
 
 		 823 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  40.34 
 
 		 596 aa  187  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.44 
 
 		 312 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  38.64 
 
 		 320 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  43.49 
 
 		 308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  41.02 
 
 		 594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  39.69 
 
 		 312 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  39.55 
 
 		 574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  40.14 
 
 		 573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  41.02 
 
 		 594 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  40.14 
 
 		 573 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  41.02 
 
 		 594 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  40.14 
 
 		 573 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  41.38 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  40.69 
 
 		 298 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  41.4 
 
 		 616 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  39.62 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  40.91 
 
 		 310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  40.97 
 
 		 573 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  38.85 
 
 		 574 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 591 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  40.74 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  40.75 
 
 		 311 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  39.63 
 
 		 307 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  40.74 
 
 		 309 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  40.3 
 
 		 301 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  40.37 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  41.35 
 
 		 550 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  42.8 
 
 		 349 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  41.15 
 
 		 329 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  42.54 
 
 		 631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  38.71 
 
 		 310 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  37.74 
 
 		 304 aa  174  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  37.74 
 
 		 304 aa  174  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  41.04 
 
 		 317 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  40.16 
 
 		 304 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  39.45 
 
 		 307 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  40.43 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  40.14 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5463  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 		 599 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  38.24 
 
 		 318 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  39.57 
 
 		 306 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  38.28 
 
 		 306 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  40.08 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  40.96 
 
 		 305 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>