25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2317 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0771  hypothetical protein  37.08 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  25.4 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  23.91 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  47.37 
 
 		 86 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  21.02 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  21.02 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  37.93 
 
 		 108 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  26.61 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  37.93 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  41.18 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  31.08 
 
 		 101 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.67 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  31.15 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  29.87 
 
 		 95 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  26.15 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2413  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  34 
 
 		 524 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  26.79 
 
 		 119 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  35 
 
 		 95 aa  41.6  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  32 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>