38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2574 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  50.81 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  38.84 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  38.84 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  37.19 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  37.19 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  37.96 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  34.43 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  34.43 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  41.94 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  37.11 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  38.78 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  31.34 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  33.87 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  37.36 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  33.06 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  30.48 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  41.84 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  44.07 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  40.4 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  33.82 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  40.74 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  37.11 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  31.96 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  51.06 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  48.94 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  48.94 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  43.5  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  29.51 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>