24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1890 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  584  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  80.65 
 
 
299 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  80.65 
 
 
299 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.1736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  80.65 
 
 
299 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  79.21 
 
 
299 aa  464  1e-130  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.17456e-06  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  79.21 
 
 
299 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  9.26677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  79.06 
 
 
296 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.38398e-07  hitchhiker  2.13318e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  78.26 
 
 
295 aa  447  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.21039e-07  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  76.7 
 
 
292 aa  446  1e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  76.81 
 
 
295 aa  439  1e-122  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.71054e-06  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  49.45 
 
 
289 aa  284  1e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  50.19 
 
 
268 aa  281  7e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.24573e-05  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  51.94 
 
 
276 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  47.58 
 
 
286 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  46.51 
 
 
278 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  48.85 
 
 
277 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  48.43 
 
 
276 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  31.44 
 
 
286 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  28.08 
 
 
264 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  24.43 
 
 
273 aa  82  9e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.67141e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  24.31 
 
 
274 aa  80.5  3e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.49733e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  24.63 
 
 
273 aa  73.9  3e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1851  hypothetical protein  25.96 
 
 
294 aa  58.5  1e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>