More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1059 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  61.71 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  59.82 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  61.88 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  58.93 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  59.19 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  60.27 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  58.64 
 
 		 601 aa  278  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  57.4 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.27 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  59.36 
 
 		 249 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  59.46 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 270 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 270 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 270 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 270 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  57.92 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.64 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  55.36 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  57.85 
 
 		 247 aa  270  9e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.82 
 
 		 436 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  60.91 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  59.91 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  60.45 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  59.91 
 
 		 250 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  58.9 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.16 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  57.27 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  59.46 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.7 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  59.46 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 250 aa  267  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  56.7 
 
 		 253 aa  266  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  58.11 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  59.91 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  56.36 
 
 		 247 aa  264  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  55.66 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  54.3 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  58.11 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  58.56 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  55.61 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  56.05 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 245 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  55.66 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  53.3 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  53.12 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.19 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  56.82 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.16 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 		 227 aa  256  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  55.25 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>