More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0389 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  100 
 
 		 501 aa  979    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  59.4 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  59.52 
 
 		 499 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  54.14 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  54.81 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  54.6 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  53.17 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  54.4 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  51.91 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  44.25 
 
 		 523 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  52.39 
 
 		 494 aa  402  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  45.64 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  46.94 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  44.4 
 
 		 542 aa  392  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  46.08 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  45.56 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  43.05 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  44.51 
 
 		 521 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  43.5 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  40.29 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  42.07 
 
 		 535 aa  329  7e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  42.62 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  38.1 
 
 		 397 aa  250  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  36.24 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  34.97 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  36.02 
 
 		 417 aa  236  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  36.02 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  35.75 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  34.67 
 
 		 422 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  34.52 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  34.73 
 
 		 422 aa  233  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  33.48 
 
 		 411 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  35 
 
 		 431 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  35.79 
 
 		 423 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  36.59 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  35.33 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  36.5 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  35.32 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  34.3 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  34.96 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  34.44 
 
 		 424 aa  225  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  34.96 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  34.96 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  35.95 
 
 		 422 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  34.96 
 
 		 429 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  34.02 
 
 		 411 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  36.08 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  34.71 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  34.85 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  34.49 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  33.63 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  34.08 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  37.56 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  34.65 
 
 		 422 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  41.53 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  34.73 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  36.63 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  35.33 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  35.41 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  36.6 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  39.84 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  34.92 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  34.92 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  34.78 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  40.16 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  38.56 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  33.06 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  31.95 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  34.68 
 
 		 411 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  32.89 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  27.51 
 
 		 538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  27.29 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  40.49 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  47.27 
 
 		 506 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  40 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  40.1 
 
 		 514 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  27.17 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  39.6 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  44.85 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  44.85 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  43.45 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  44.24 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  40.1 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  43.45 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  27.17 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  42.41 
 
 		 599 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  26.45 
 
 		 391 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  44.38 
 
 		 539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  35.75 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  38.04 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  38.69 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  40.37 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  35.08 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1023  phosphate transporter  29.66 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.880841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  25.57 
 
 		 336 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  30.56 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  30.56 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  35.97 
 
 		 596 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  26.54 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  29.49 
 
 		 336 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>