15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0040 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0040  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  766    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13813  hitchhiker  0.00125865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3564  hypothetical protein  30.52 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.408858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1700  hypothetical protein  29.32 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2754  hypothetical protein  29.35 
 
 		 442 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0984  hypothetical protein  26.59 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2646  hypothetical protein  29.72 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.458074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2579  hypothetical protein  29.44 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2837  hypothetical protein  28.77 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130589  normal  0.483673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1509  hypothetical protein  28.61 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1518  hypothetical protein  28.3 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1416  hypothetical protein  27.79 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1545  hypothetical protein  28.3 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0655  hypothetical protein  29.16 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1018  hypothetical protein  20.06 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0985  hypothetical protein  20.06 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>